Depuis la disparition de son père, Anna vit seule avec sa mère, de plus en plus étrange et protectrice : livres, amis et sorties lui sont interdits. Pour s’échapper, elle grimpe chaque jour quelques centimètres d’une vigne de la serre familiale, jusqu’au toit. En chemin, elle se lie d’amitié avec Marionnette et rencontre Bob et Lucie, duo de libraires attachants. Leur aventure les mène à l’étrange usine à trous de M. Flanagan. Pour sauver son père et comprendre ce monde fou, Anna devra faire preuve d’ingéniosité… et peut-être compter sur une mystérieuse théorie scientifique.